MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 110190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009565	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
3	NC_009565	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
4	NC_009565	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
5	NC_009565	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
6	NC_009565	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
7	NC_009565	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
8	NC_009565	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
9	NC_009565	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
10	NC_009565	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
11	NC_009565	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	148821192
12	NC_009565	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
13	NC_009565	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
14	NC_009565	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
15	NC_009565	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821192
16	NC_009565	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	148821192
17	NC_009565	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
18	NC_009565	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	148821192
19	NC_009565	AC	3	6	744	749	50 %	0 %	0 %	50 %	148821192
20	NC_009565	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	148821192
21	NC_009565	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821192
22	NC_009565	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
23	NC_009565	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821192
24	NC_009565	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821192
25	NC_009565	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	148821192
26	NC_009565	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	148821192
27	NC_009565	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
28	NC_009565	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
29	NC_009565	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
30	NC_009565	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
31	NC_009565	GC	3	6	1222	1227	0 %	0 %	50 %	50 %	148821192
32	NC_009565	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821192
33	NC_009565	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
34	NC_009565	CA	3	6	1509	1514	50 %	0 %	0 %	50 %	148821192
35	NC_009565	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
36	NC_009565	TTC	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009565	A	7	7	1654	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009565	TC	4	8	1663	1670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009565	CGG	2	6	1744	1749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009565	AC	4	8	1787	1794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009565	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009565	TCG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009565	ACC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009565	TCG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009565	ATG	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009565	GTT	3	9	2026	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009565	CTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009565	CGT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009565	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009565	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	148821193
51	NC_009565	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	148821193
52	NC_009565	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	148821193
53	NC_009565	CGGTGC	2	12	2265	2276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148821193
54	NC_009565	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
55	NC_009565	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
56	NC_009565	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
57	NC_009565	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
58	NC_009565	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
59	NC_009565	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148821193
60	NC_009565	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	148821193
61	NC_009565	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
62	NC_009565	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
63	NC_009565	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821193
64	NC_009565	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821193
65	NC_009565	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
66	NC_009565	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821193
67	NC_009565	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	148821193
68	NC_009565	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
69	NC_009565	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821193
70	NC_009565	AC	3	6	2956	2961	50 %	0 %	0 %	50 %	148821193
71	NC_009565	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821193
72	NC_009565	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	148821193
73	NC_009565	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821193
74	NC_009565	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
75	NC_009565	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	148821193
76	NC_009565	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	148821193
77	NC_009565	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821193
78	NC_009565	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	148821193
79	NC_009565	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	148821194
80	NC_009565	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
81	NC_009565	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
82	NC_009565	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	148821194
83	NC_009565	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
84	NC_009565	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
85	NC_009565	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821194
86	NC_009565	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821194
87	NC_009565	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
88	NC_009565	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	148821194
89	NC_009565	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
90	NC_009565	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821194
91	NC_009565	GT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	50 %	0 %	148821194
92	NC_009565	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
93	NC_009565	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	148821194
94	NC_009565	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821194
95	NC_009565	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
96	NC_009565	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
97	NC_009565	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
98	NC_009565	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
99	NC_009565	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
100	NC_009565	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
101	NC_009565	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
102	NC_009565	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
103	NC_009565	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
104	NC_009565	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821194
105	NC_009565	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821194
106	NC_009565	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
107	NC_009565	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821195
108	NC_009565	CG	5	10	4643	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	148821195
109	NC_009565	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	148821195
110	NC_009565	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821195
111	NC_009565	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821195
112	NC_009565	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821195
113	NC_009565	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821195
114	NC_009565	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821195
115	NC_009565	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821195
116	NC_009565	CG	3	6	5079	5084	0 %	0 %	50 %	50 %	148821195
117	NC_009565	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009565	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
119	NC_009565	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
120	NC_009565	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
121	NC_009565	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821196
122	NC_009565	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
123	NC_009565	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
124	NC_009565	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
125	NC_009565	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
126	NC_009565	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
127	NC_009565	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	148821196
128	NC_009565	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
129	NC_009565	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
130	NC_009565	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
131	NC_009565	CGGCGT	2	12	5703	5714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148821196
132	NC_009565	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
133	NC_009565	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	148821196
134	NC_009565	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
135	NC_009565	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	148821196
136	NC_009565	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821196
137	NC_009565	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
138	NC_009565	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
139	NC_009565	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
140	NC_009565	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
141	NC_009565	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
142	NC_009565	GC	3	6	6305	6310	0 %	0 %	50 %	50 %	148821196
143	NC_009565	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
144	NC_009565	AAGGAC	2	12	6355	6366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148821196
145	NC_009565	AGACCA	2	12	6449	6460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148821196
146	NC_009565	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
147	NC_009565	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	148821196
148	NC_009565	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821196
149	NC_009565	GC	3	6	6811	6816	0 %	0 %	50 %	50 %	148821196
150	NC_009565	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821196
151	NC_009565	ACG	2	6	6881	6886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
152	NC_009565	TGT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
153	NC_009565	GTT	3	9	6978	6986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
154	NC_009565	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821196
155	NC_009565	CTG	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
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157	NC_009565	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821196
158	NC_009565	ACC	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821196
159	NC_009565	GT	3	6	7232	7237	0 %	50 %	50 %	0 %	148821196
160	NC_009565	GAC	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
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162	NC_009565	GTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
163	NC_009565	CG	3	6	7311	7316	0 %	0 %	50 %	50 %	148821196
164	NC_009565	GACA	2	8	7405	7412	50 %	0 %	25 %	25 %	148821197
165	NC_009565	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821197
166	NC_009565	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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171	NC_009565	CGGT	2	8	7625	7632	0 %	25 %	50 %	25 %	148821197
172	NC_009565	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821197
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175	NC_009565	CGA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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218	NC_009565	CGA	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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225	NC_009565	CGA	3	9	9706	9714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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230	NC_009565	GAA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821197
231	NC_009565	CGA	2	6	9871	9876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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233	NC_009565	CGA	3	9	9931	9939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_009565	GAG	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_009565	CGC	2	6	10142	10147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821198
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242	NC_009565	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	148821198
243	NC_009565	GCC	2	6	10486	10491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821198
244	NC_009565	GCG	2	6	10499	10504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821198
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246	NC_009565	TGT	3	9	10631	10639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821198
247	NC_009565	TTC	2	6	10651	10656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821198
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256	NC_009565	TCG	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_009565	TCC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_009565	ACG	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_009565	GGC	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009565	TCG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009565	CCT	2	6	11184	11189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_009565	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_009565	CGG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_009565	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_009565	ACC	2	6	11526	11531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
266	NC_009565	ACC	3	9	11596	11604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_009565	GCC	2	6	11633	11638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_009565	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
269	NC_009565	CCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_009565	CGA	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_009565	ACT	2	6	11842	11847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_009565	CAT	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_009565	GAC	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_009565	GGT	2	6	12003	12008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821199
275	NC_009565	CGA	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821199
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286	NC_009565	GCC	2	6	12416	12421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_009565	CGG	2	6	12496	12501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_009565	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
289	NC_009565	ACG	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821200
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302	NC_009565	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	148821201
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304	NC_009565	CAC	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
305	NC_009565	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
306	NC_009565	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
307	NC_009565	CGG	2	6	13803	13808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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343	NC_009565	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	148821204
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